Направление на стажировку из ВУЗа

Добрый день.

Прошу вас проконсультировать меня по следующему вопросу.

Являясь сотрудником одного из российских государственных Высших учебных заведений, я выиграл зарубежную стажировку на 6 месяцев (175 дней) в Австрии. Финансирование всех расходов, которые я должен был понести (и несу) в связи с моим пребыванием за границей, осуществляет частный Фонд, поддержавший мой научный проект, а не ВУЗ.

Я был направлен на стажировку из университета по приказу ректора (приказ подписан ректором, главным бухгалтером, правовым управлением и начальником управления делами), который в данный момент существует в ВУЗе в бумажной версии, а также в виде скан-копии у меня.

В связи с тем, что по основному рабочему месту я имею бессрочный трудовой договор, на время моего отсутствия на мое рабочее место был взят другой сотрудник (на временной основе).

Однако спустя три месяца главный бухгалтер ВУЗа подняла вопрос о том - на каком основании я получаю зарплату, находясь в командировке при том, что сотрудник, замещающий меня, также получает зарплату. Итогом действий главного бухгалтера стало то, что в апреле мне не была начислена очередная средняя зарплата, равно как и замещающему меня сотруднику она также не была начислена. Среди прочих возможностей решения сложившейся ситуации в ВУЗе рассматривался вопрос о применении "административного" ресурса - вынудить меня написать заявление об отказе от оформления моей стажировки как командировки и оформить ее как отпуск за свой счет. Имея приказ ректора о направлении меня в командировку (с прописанным количеством дней, источником финансирования и т.д.), я отказался что-либо писать.

Буду вам очень признателен, если поможете мне разобраться в данной ситуации. Спасибо