Резиденты «Сколково» под ударом: почему ФНС взялась за IT-льготы?

Содержание

Здравствуйте, дорогие слушатели. Меня зовут Юлия Баранова, я партнёр юридической компании «Туров и Партнёры». Сегодня поговорим о теме, вокруг которой в последнее время разворачивается всё больше споров, — о резидентах «Сколково», которые пытались одновременно применять и сколковские льготы, и льготы аккредитованной IT-компании.

Что произошло с 2026 года

С 1 января 2026 года вступили в силу изменения Налогового кодекса, принятые законом от 28 ноября 2025 года. Теперь действует прямая позиция: одновременно льготы резидента «Сколково» и аккредитованной IT-компании не применяются. Многие компании из-за этого попали под доначисления.

Парадокс в том, что, несмотря на то что ограничение официально действует только с 1 января 2026 года, часть компаний получила претензии за предыдущие периоды — 2023–2025 годы. Казалось бы, ужесточение требований не должно иметь обратной силы, но на практике вышло иначе.

Как устроена сколковская льгота

Участники «Сколково» получают привлекательный налоговый режим: в течение 10 лет со дня получения статуса они вправе пользоваться освобождением от налога на прибыль при соблюдении определённых условий, а также освобождением от НДС. Но льгота по прибыли устроена не так просто — статус не означает автоматическую нулевую ставку на все 10 лет.

Есть два финансовых порога. Первый — 1 млрд рублей выручки: если годовая выручка превышает этот уровень, право на освобождение утрачивается с начала соответствующего налогового периода. Второй — 300 млн рублей совокупной прибыли, рассчитываемой по специальным правилам с момента прекращения освобождения по первому порогу. В периоде, когда превышен второй порог, нулевая сколковская ставка прекращает работать, и налог считается по общей ставке — 25%.

То есть компания, которая изначально рассчитывала на нулевую ставку резидента «Сколково», в моменте попадает на 25% — и ещё получает претензии за предыдущие периоды, где как раз возникло разногласие с IT-льготой. По данным РБК и «Коммерсанта», это коснулось порядка пятидесяти организаций, у которых одновременно были и статус резидента «Сколково», и государственная IT-аккредитация.

Почему это вообще стало возможно

Для обычной аккредитованной IT-компании в 2025–2030 годах предусмотрена льготная ставка налога на прибыль: 5% в федеральный бюджет и 0% в региональный — то есть фактически 5%, при условии что доля профильных доходов не менее 70%. Многие компании это условие соблюдали.

Формально совмещение сколковской и IT-льготы прямо не запрещалось. В 2020 году ФНС, соглашаясь с Минфином, разъясняла, что резидент «Сколково» со статусом IT-компании может сочетать отдельные преференции — например, пользоваться сколковским освобождением от налога на прибыль и НДС, а страховые взносы платить по правилам для IT-компаний. Показательное письмо Минфина в ноябре 2024 года также говорило, что Налоговый кодекс не содержит прямого запрета на применение IT-ставки по налогу на прибыль резидентом «Сколково», если выполняются условия.

Позиция ФНС по делам за прошлые периоды

В октябре 2025 года налоговая разобрала показательную ситуацию. Компания до начала 2024 года одновременно соответствовала условиям и для сколковской ставки 0%, и для IT-ставки 0%, но выбрала именно сколковскую льготу. В течение года её прибыль превысила порог в 300 млн рублей, и логика налогоплательщика была простой: раз сколковская льгота потеряна, можно перейти на IT-льготу и продолжать платить 0%.

ФНС с этим не согласилась: по её позиции специальный порядок, установленный пунктом 5.1 статьи 284 Налогового кодекса, имеет приоритет, и если компания начала период на сколковской льготе, но потеряла право на неё из-за превышения лимита, она не может задним числом применить IT-льготу за тот же период. Именно из-за этого и возникли претензии за старые периоды — профессиональное сообщество указывает, что прямой запрет заработал только с января 2026 года, но налоговая пытается распространить его и на предыдущие периоды.

Что именно изменилось с 2026 года

С 2026 года введено прямое разграничение: по налогу на прибыль одновременно не применяются и IT-льготы, и сколковские льготы. То же самое разграничение действует и по страховым взносам — действующий резидент «Сколково» не может использовать льготный тариф, установленный для IT-компаний, вместо режима, предусмотренного для участников проекта.

Резиденту «Сколково» в 2026 году в принципе запрещены все общие IT-льготы: это касается прежде всего IT-ставки по налогу на прибыль и IT-тарифов по страховым взносам. Отдельно, по своим правилам, регулируется освобождение от НДС отдельных операций с программным обеспечением — по сути, это единственное, чем ещё могут пользоваться резиденты «Сколково» из IT-льгот.

Как именно происходит переход между режимами

Минфин в письме от 30 июля 2026 года закрепил механику перехода. Если IT-компания теряет статус участника «Сколково» в течение 2026 года, перейти по налогу на прибыль на IT-ставку 5% в этом же году нельзя — только с 2027 года. В год утраты статуса компания будет платить налог на прибыль по стандартной ставке 25%.

Со страховыми взносами механизм более лояльный: если, например, компания потеряла статус участника «Сколково» в августе 2026 года, IT-тариф страховых взносов можно применять уже с августа — при условии соблюдения остальных требований для IT-льготы. Проще запомнить так: по прибыли переход — только со следующего года, потому что налоговый период по прибыли — целый год; по страховым — с месяца утраты статуса.

Что делать бизнесу

Любой предприниматель должен строить бизнес-модель исходя из действующих норм законодательства, а не рассчитывать льготы «на глазок». Многие компании оформляли IT-аккредитацию именно ради экономии на страховых взносах, но не всегда соблюдали требование о 70% профильных доходов.

Если бизнес-модель строится на льготах и преференциях определённого региона или отрасли, важно закладывать все возможные последствия их изменения. Если льгота стабильна и изменений давно не было и не планируется — можно спокойно на неё опираться. Если нет — нужно просчитывать варианты заранее, а не после получения требования от инспекции.

Если сомневаетесь, как правильно просчитать варианты, не тратьте время — обращайтесь к профессионалам. Юристы компании «Туров и Партнёры» умеют работать с налоговым законодательством и просчитывать риски на основании ваших же цифр. Рекомендуем сначала проконсультироваться с экспертами, а уже потом запускать выбранную модель.

На этом у меня всё. Надеюсь, эта информация была для вас интересной и полезной — в том числе для участников «Сколково» с IT-аккредитацией. Всего вам доброго, успехов вам и процветания.

Видеообзоры о налогах и бизнесе в 2026 году — оптимизация налогов и защита активов:

• Маркетплейсы под колпаком ФНС: ваши продажи, скидки и схемы увидят все?
• Бизнес уже тонет, а вы отказываетесь от спасательного круга?
• Все статьи колонки "Налоги ТВ — обзоры компании Туров и партнеры"