Какие трудности могут возникнуть после оформления временной регистрации в квартире дальнего родственника?

Вы серьезно хотите получить компетентный ответ от незнакомых людей в интернете? 

Смотрите, заходите сюда, оформляете бесплатный доступ на 2 дня ко всей базе знаний Консультант + и за это время находите и ответ на свой вопрос, и судебную практику, и все формы документов с примерами заполнения, какие вам только понадобятся.

Никакая регистрация не дает права собственности. Тем более при временной регистрации Вы можете выписать ее в любой момент, в отличие от постоянной, при которой выписка - по решению суда. Но квартплата увеличится.

Никаких трудностей у вас не может возникнуть. Временно прописанные граждане утрачивают право проживания с момента истечения срока регистрации. Сведения о регистрации временных жильцов не вносятся в поквартирную карточку. Если у вас квартира в собственности, то вообще никаких ограничений ваших прав это не влечет.

Уточнение от 25 февраля 2013 - 01:17
Укажите короткий срок регистрации в заявлении, чтобы избежать конфликтов, связанных со снятием с регистрации этих граждан. Сумму, на которую увеличится квартплата, берите с них.

Не обольщайтесь. До истечения срока временной регистрации жильца можно будет выписать только через суд или в добровольном порядке (то есть если мама Вашей родственницы сама захочет выписаться раньше). Одного Вашего желания для ее выписки до окончания срока регистрации будет недостаточно.