Как не потерять налоговые льготы медицинскому и образовательному бизнесу?

Всем привет. На связи Марат Самитов. В этом видео я расскажу, как налоговая инспекция проверяет медицинский и образовательный бизнес. В последнее время ФНС активно взялась именно за эти компании: по её собственной оценке, около 5% организаций из медицинской и образовательной сферы имеют риск доначисления налога на прибыль, НДС или страховых взносов.

Почему налоговая взялась именно за эти отрасли? Потому что здесь большой потенциал доначислений — если нарушаются формальные требования или компания маскирует под медицинскую или образовательную деятельность какую-то другую. Компании, которые занимаются образовательной или медицинской деятельностью, не уплачивают НДС 20%, не платят налог на прибыль (ставка 0%) и фактически перечисляют только страховые взносы и НДФЛ за сотрудников, а также, возможно, транспортный и имущественный налоги — но это уже небольшие суммы.

Если организация теряет право на нулевую ставку по налогу на прибыль, за весь год доначисляется 25% налога плюс пени и штрафы. А главное — после этого компания не имеет права применять льготу в течение 5 лет.

Условия нулевой ставки для медицинских компаний

Чтобы получить нулевую ставку по налогу на прибыль, медицинской компании нужна лицензия на профильную деятельность. Не менее 90% доходов должно приходиться именно на медицинскую деятельность. В штате должно быть не менее 15 сотрудников. У организации не должно быть операций с векселями, ценными бумагами и другими финансовыми инструментами.

Для медицинских компаний есть дополнительное требование — численность медицинского персонала, имеющего сертификат соответствия либо свидетельство об аккредитации, должна быть не менее 50%. С 1 января добавили ещё одно требование: ставка 0% недоступна компаниям, среди учредителей которых есть иностранные агенты с долей 10% и более, либо если сама медкомпания имеет статус иностранного агента.

Условия льготы для образовательных организаций

У образовательных компаний тоже обязательна лицензия и обязателен статус некоммерческой организации. Обычные ООО, к сожалению, не имеют права на нулевую ставку по налогу на прибыль.

Освобождение от НДС

Есть ещё освобождение от уплаты НДС. Оно применяется не ко всей медицинской или образовательной деятельности, а только к определённым видам. Например, льгота может применяться при реализации медицинских или протезно-ортопедических изделий, при стоматологии. Но нельзя получить освобождение от НДС, если вы оказываете косметические услуги или санитарно-эпидемиологические услуги. В образовательной сфере также нужна лицензия и статус некоммерческой организации.

Проверка реальной сути операций

Если компания пытается выдать свою деятельность за образовательную или медицинскую, налоговая может подойти не только формально, а вникнуть в суть операции и понять, действительно ли она имеет право на освобождение. Например, одну клинику репродуктивного здоровья одновременно проверяли налоговая инспекция, Росздравнадзор и Роспотребнадзор — каждый в рамках своих полномочий, но все пытались разобраться, являются ли эти услуги медицинскими и есть ли право на освобождение от НДС.

Если у налоговой есть подозрения, она сначала рассылает уведомления, чтобы налогоплательщик сам уточнился, сдал декларации и доплатил налоги — так можно избежать штрафов. Если результата нет, налоговая может прийти с выездной проверкой. Только в первом квартале 2026 года налогоплательщики уже самостоятельно доплатили в бюджет 175 млрд рублей. При этом количество самих налоговых проверок по сравнению с 2025 годом не растёт, а даже сократилось на 1% — но растут качество и глубина проверки.

На что смотрит ФНС: доля доходов, самозанятые, структура группы

Как только доля профильных доходов приближается к 90%, это становится дополнительным маркером для налоговой — приехать и проверить, правильно ли компания считает доходы. Вопросы могут возникнуть, если есть непрофильные доходы: от продажи имущества, внереализационные доходы, проценты по займам и овернайтам, курсовые разницы, доходы от аренды и другие поступления, которые компании иногда учитывают так, как выгодно, а не так, как правильно. Налоговая видит здесь зону риска — и зону для доначислений.

Медицинские и образовательные компании могут привлекать самозанятых, и тогда доля профильного персонала может оказаться ниже установленной законом нормы. Тогда возникает вопрос, имеет ли право самозанятый вообще работать в медицинской компании — по позиции Минфина это возможно, но у самозанятого должна быть лицензия.

Отдельно налоговая проверяет саму суть хозяйственных операций и может смотреть на весь бизнес целиком: это вообще медицинская или образовательная деятельность? Недостаточно просто прописать в документах, что услуга образовательная. В образовательном бизнесе вопросы вызывают, например, тренинги, услуги бизнес-клубов и консультационные услуги. В медицинском бизнесе пограничная история — эстетические и косметологические процедуры и другие услуги, которые могут не соответствовать критериям льготы.

Особое внимание привлекают группы компаний, где рядом с медицинской или образовательной организацией со ставкой 0% работает ещё одно юрлицо на общей системе — с налогом на прибыль 25% и уплатой НДС, которое оказывает какие-то непрофильные услуги или продаёт сопутствующий товар. Здесь налоговая анализирует расходы: часто, чтобы уменьшить налог на прибыль по этому юрлицу, на него перекладывают расходы льготной компании.

Ещё один риск — структура персонала. Если непрофильного персонала слишком много и медицинских сотрудников с аккредитацией меньше 50%, а компания, чтобы соблюсти норму, переводит непрофильный персонал в аффилированную структуру, — это тоже сигнал для проверки. Вопросы вызывает и ситуация, когда у топ-менеджеров медицинской компании маленькая официальная зарплата, но при этом они входят в состав учредителей и регулярно получают дивиденды: так экономят на НДФЛ и страховых взносах — налог на прибыль 0%, дивиденды облагаются по ставке 13–15%, а страховые взносы с них платить не нужно. Поэтому важно, чтобы выплата дивидендов учредителям была экономически оправданной.

IT-льготы и последствия потери ставки

Пятое направление, по которому налоговики могут доначислить НДФЛ и взносы, — это использование IT-льгот. Многие образовательные компании сегодня работают как онлайн-платформы, формально не являясь образовательными организациями, но пользуясь льготами, предусмотренными для IT-компаний. Такие компании налоговики тоже активно проверяют.

Если права на нулевую ставку за весь период нет, доначислят либо налог на прибыль, либо НДС, а возможно и то и другое — налоговая нагрузка резко вырастает. В итоге медицинским и образовательным компаниям приходится либо закладывать эти риски в цену и повышать стоимость услуг, либо снижать расходы, а вместе с ними и качество медицинских и образовательных услуг.

Даже у серьёзной компании с лицензией, давней историей на рынке, имуществом и оборудованием на балансе это не гарантирует, что налоговая не придёт. Поэтому, если вы сомневаетесь, правильно ли применяете льготы и какие у вас налоговые риски, напишите мне в личные сообщения либо оставьте заявку по ссылке под этим видео. Мы посмотрим, в чём у вас есть риски, сделаем бухгалтерский и налоговый аудит и подскажем, как подстелить соломки.