Как должен вестись расчет базы для уплаты НДС?

Налогооблагаемая база при расчете НДС.

При реализации товара расчет НДС как правило сводится к указанию (выделению) в цене товара ставки НДС 18%. Однако стоимость (цена) товара (например объектом является произведенное оборудование) состоит из различных затрат. Это затраты на запчасти, ФОТ, услуги оказанные субъектами предпринимательства, использующими различные виды налогооблажения, прочие расходы и т.д. и т.п. При возмещении НДС является логичным возврат разницы между вновь начисленными 18% НДС и теми НДС, которые были начислены на расходы, учавствующие в формировании цены товара, и уплаченные поставщиками ранее (или не уплаченные для усн например).

Однако мне не ясно почему данный косвенный налог НДС в итоге косвенно начисляется и на ФОТ. Ведь нигде в НК РФ не указано что затраты на ФОТ, кроме всех социалок и НДФЛ еще и НДС должен облагаться. И расходы на ФОТ на мой взгляд не верно относить к услугам например, как в случае с услугами от ИП УСН.

И пример:

по договору реализован товар по цене 100 000 рублей. НДС выделяем 15254,24. Налогооблагаемая база сложилась из стоимости запчастей 30000,00 рублей ( в т.ч. НДС 4576,27), транспортных услуг 30000,00 рублей (без НДС, усн), ФОТ 30000,00 и прибыли 10000,00 рублей. В итоге имеем к оплате НДС 15254,24 - 4576,27 = 10677,97 рублей. Т.е. не хотя (или хотя) мы обложили и ФОТ налогом на ДС. Т.е. арифметика.

Почему так? Почему при расчете налогооблагаемой базы для уплаты НДС из базы не вычитается ФОТ, который не является услугой или товаром? Тем более что этот ФОТ и так сильно налогами завешан.

Вопрос относится к городу Йошкар-Ола